对于
红外线气体分析仪来说，采样点的正确选择和气体预处理系统的安装与仪器本身的质量一样重要。只有保证仪器的气室不被污染，才能得到正确的分析结果。采样点应选择在代表气体侧，以便测量实际气体浓度。如果气体浓度分层分布，则必须对其整个横截面进行测试，以确定最佳采样点。
样气应进行过滤以去除灰尘。对于湿度大、露点高于室温的气体，应加热过滤器和导管，防止样气通过仪器时产生冷凝。对于粘性组分，应提前选择合适的过滤器进行分离，必要时进行加热。总之，在仪器安装前，应仔细选择采样点，并考虑预处理系统。
过滤气室又称过滤气室，因为红外线气体分析仪如果不配备过滤气室，就无法克服背景气体对分析气体中待测成分的干扰。例如，在合成氨的生产中，应分析一氧化碳的含量。背景气体含有N2、H2、CO2等成分。N2和H2是同一种原子组成的双原子气体，不吸收1-25μM波长的红外辐射能量，但CO和CO2的特征吸收波长范围重叠，明显会对CO测量造成CO2干扰。
为了避免干扰成分的存在造成红外线气体分析仪测量误差，在对含有干扰成分的混合气体成分进行分析时，设置了过滤气室。过滤气室充满与被测成分（干扰气体）浓度相同的气体和中性气体的混合气体。这样，当脉冲红外光谱通过滤光室时，干扰成分会根据自身特性吸收该波长，并吸收该范围内的所有红外线。此时接收器气室两侧的红外辐射能量之差仅为通过过滤气室和参比气室后未被吸收的红外线与被分析组分吸收后的红外线之差。该差异与待测组分的浓度成正比。
